該劇由來自《迷失》的制片人組合J.J. Abrams和Bryan Burk打造。　　第二季的故事緊接着第一季，在Finch（邁克爾·愛默生 Michael Emerson 飾）被神秘的Root小姐綁架以後，「西裝男」John Reese（詹姆斯·卡維澤 James Caviezel 飾）只得求助於他在紐約警局凶殺科的偵探朋友們Carter（塔拉吉·P·漢森 Taraji P. Henson 飾）以及Fusco（凱文·查普曼 Kevin Chapman 飾）的幫助，經過縝密調查，終於將Finch救出，卻被Root逃脫。看似恢復如初的生活，其實暗藏危機。除了，一心想要把Finch的程序公開化的Root以外，他們還要找出HR真正的幕後黑手。另一方面，聯邦調查局和中央情報局都在不遺余力地想要找出John。只要機器存在一天，這個城市仿佛從來不讓他們休息........