在電影FTF里出現的變種alien從一個基因技術研究公司的員工肚子里鑽出來逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他帶Mulder去找那個alien。Scully證明出Gibson可能是外星人（所有人類都可能是）。X檔案現在由Spender和Fowley主管。Gibson最後又不見了。