《戰國BASARA》中活躍的武將們，在現代高中再次展開了激烈的戰斗：前任學生會長「豐臣秀吉」遭到停學處分，學園內群雄割據，為爭奪新會長之位成為亂世。足球社的王牌「真田幸村」、棒球部的王牌「伊達政宗」，高呼着團結就是力量的「德川家康」，矢志打倒家康的「石田三成」等人紛紛參戰——這個混亂的學園，還會有明天嗎？