1590年，科羅拉多派遣由弗納多?德加瑪將軍（Miguel Martinez 飾）率領的一千人部隊，進入傳奇的黃金城市埃爾多拉多尋找黃金，但他們遭遇了骷髏軍團的襲擊，一千人無一生還。　　時間推至現代，戈登教授（Miguel Martinez 飾）率領一群年輕人組織的考古隊前來尋找黃金城舊址，受到三個開着越野吉普的年輕人的脅迫，考古隊被迫與他們同行。幾經周折，他們終於找到埋藏着皚皚白骨和黃金的山洞，這群不速之客吵醒了守衛黃金的骷髏軍團，一場古代對現代、骷髏對人類的戰爭旋即展開。