超星特工豬豬俠在上次的任務中留下了後遺症，但他堅持獨自潛入海底世界執行新任務。在五彩繽紛的海底世界見識到各種各樣的海底生物，結識了正在尋找哥哥的小豆芽，受小豆芽勇敢執着的精神所打動，豬豬俠決定幫助小豆芽，幫他一起尋找哥哥。原來海洋世界發生了一件不為人知的大事，導致大量海洋「居民」失蹤。這件事並不簡單，背後隱藏着一個危及海洋世界和平的大危機。豬豬俠這次要如何克服困難，突破自我，解除海洋大危機呢？