故事設定在《哥斯拉2：怪獸之王》里哥斯拉和泰坦巨獸之間的驚天大戰夷平了舊金山，以及確認怪獸是真實存在的現狀後，凱特再次被一個令人震驚的秘密嚇壞了。面對巨大的威脅，她踏上了環球冒險之旅，以了解有關家人和名為「帝王」之神秘組織的真相。