「超」音速的索尼克（本·施瓦茨 Ben Schwartz 配音）與「超」呆萌的塔爾斯（科琳·歐肖內希 Colleen O'Shaughnessey 配音）和「超」強壯的納克魯斯（伊德里斯·艾爾巴 Idris Elba 配音），三人小隊再次踏上歡樂冒險！這一次他們將面對前所未有的勁敵——夏特（基努·里維斯 Keanu Reeves 配音），然而索尼克小隊與強大的夏特實力相差懸殊，為了解決這個棘手的神秘敵人，索尼克找到了老對手蛋頭博士（金·凱瑞 Jim Carrey 飾）聯手阻止夏特，關於夏特的秘密也逐漸浮出水面，這場危機背後還有更狡猾的黑手。索尼克小隊能否團結一致擊敗夏特並拯救世界？